Easy-RNASeq转录组测序服务

转录组测

转录组是指某个物种特定细胞或组织在某一状态下所转录出来产生的所有转录本的集合。转录组测序基于高通量测序可快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的所有转录本的集合,可定量测定每个转录本在生长过程中和不同的条件下的表达水平的变化,可用于研究基因结构和基因功能、可变剪接和新转录本预测等。

Easy-RNASeq是微浪生物推出的一种mRNA测序服务,通过独特的构库方法和自动化平台获得超灵敏、高通量和高重复度的mRNA测序实验结果。 

应用领域

生长发育的生理机制

免疫应答、干细胞研究

药物作用机制及靶点

癌症研究及标记物

微生物感染致病机理研究

等等

    1 微量RNA样品的超灵敏检测

    Easy-RNASeq可用于ng-μg级的RNA样本转录组测序。即使1ngRNA样本、100个细胞样本和少量的组织样本,Easy-RNASeq技术能超灵敏测到1.5万以上的转录基因,并且与大量RNA样本测序结果具有高相关性。

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                                                                                           图1 EASY-RNASeq检出基因数比较                                                                               

    2 具有高效的构库测序饱和度

    与其他转录组测序技术相比,Easy-RNASeq具有更为陡峭的测序饱和度曲线,能在测序量为20M时达到测序饱和平台,在降低测序成本的同时可检测到更多低表达基因,更为有效的获得转录组差异基因。

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图2Easy-RNASeq基因检测饱和曲线

    3可靠的实验重复性

    微浪生物云实验室采用ReadyGO实验机器人构建Easy RNA-Seq自动化实验平台,实现Easy-RNASeq的自动化构库,极大降低操作失误和样本污染,在结果可靠性和重复性上明显优于人工操作。

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                                                                                                                                     图3  同组样本1和样本2结果比较

    4完整的生物信息学分析

    微浪生物专业的生物信息学分析团队,为Easy-RNASeq检测提供完整的生物信息学分析,包含测序数据质量控制和基因表达差异分析,并为您提供差异表达基因的聚类分析、GO富集和KEGG通路富集分析。

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         结果分析示例:聚类分析                                                                                                              结果分析示例:差异基因GO注释结果

  

  5技术流程

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    6样品要求

    组织样品:要求动物、植物、微生物总量大于2 g的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用RNAlater和液氮速冻,保存于-80℃(保存期不超过一个月),送样时使用干冰运输(不超过72 h)

    细胞样品:先使用TRIzol试剂进行处理,每0.25 mL样品(5-10×106个细胞)加入0.75 mL TRIzol试剂(可参考TRIzol试剂说明书),于-80℃保存,并提供2-3份该样品。原则上不接收未经TRIzol处理的细胞     样品。

    样品保存期间切忌反复冻融。

    特殊样本请联系微浪生物工作人员:023-68103898

   7项目周期

   标准流程的运转周期为35个工作日

   8参考文献

   Streamlined low-input transcriptomics through EASY-RNAseq

   论文网址:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/564468v1